1.饮食结构正常、膳食均衡的人往往肠道都比较健康；而膳食纤维摄入不足、高脂、高糖、高蛋白的饮食习惯，容易导致肠道内有害菌生长旺盛、益生菌减少，肠道菌群失调。
2.健康的肠道和某些食物、饮料之间有很强的相关性。水果、蔬菜、咖啡、酸奶、牛奶和红葡萄酒与肠道菌群的多样性相关性较强。红葡萄酒、蓝莓、绿茶、咖啡和可可等食物中的多酚类应该和肠道菌群的健康高度相关。但碳酸饮料和碳水化合物含量较高的食物相关性较低。纤维可以有效驱动健康微生物组的形成，由于日常饮食中摄入的纤维，多数是机体无法分解的碳水化合物，而摄入水果和蔬菜，可以有效促进肠道中的细菌对纤维的利用。但酒精对健康有诸多危害，因此，为了健康饮酒要适量。
3.果蔬汁、核桃、橄榄油都能促进肠道益生菌生长和菌群多样性。芒果，有助于防止高脂膳食引起的肠道益生菌的流失。
4.西兰花、甘蓝和白菜等十字花科蔬菜有助于保持肠道菌群和免疫系统的健康平衡，并增强人体胃肠道屏障功能，这有助于预防肠道炎症引起的各种疾病。
改变饮食是改变肠道菌群最好最直接的途径，人们可以通过改变饮食习惯来重塑造健康的肠道菌群，以此来改善人体健康。
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