肠菌群失调

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TUhjnbcbe - 2020/12/21 1:58:00
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文章首先进行溃疡性结肠炎(UC)及结肠癌(CRC)动物模型的复制,收集血浆、粪便进行代谢组学研究,结肠组织进行粘膜损伤程度病理切片的观察。

1、病理切片结果

2、血浆、粪便样本的LC/MS代谢组学分析

质谱仪器为Q-TOF,数据处理采用MarkerView1.3.1版本进行提峰,再进行多元统计分析。

差异代谢物及变化趋势如下表,再对差异代谢物进行heatmap及MetPA分析,得到UC、CRC共有的代谢通路。

3、粪便肠道菌群结果

分别从门、纲、目、科、属水平对丰度排列在前10位的菌群进行分析。

表2总结了门、纲、目、科、属水平有显著性变化的菌群:

4、肠道菌群与代谢组学结果进行Pearson相关分析,及绘制的通路图

文章评述:

1、LC/MS代谢组学的分析方法采用了6个提取离子峰从精密度、重复性及稳定性方面进行了方法学考察;

2、文章病理切片及粪便状态均采用打分得到综合评分,进行模型评价,可以丰富文章结果;

3、文章聚焦的亚油酸通路仅通过MetPA分析及相关分析综合得到,并未对亚油酸通路进一步验证。

参考文献:TangQ,CangS,JiaoJ,RongW,XuH,BiK,LiQ,LiuR.Integratedstudyofmetabolomicsandgutmetabolicactivityfromulcerativecolitistocolorectalcancer:The

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