最近的很多研究证实，肠道菌群失调是造成很多肠道炎症疾病（艰难梭菌感染、克罗恩病、结肠炎等等）甚至全身性慢性疾病（比如肥胖、糖尿病、动脉粥样硬化）等等疾病的重要原因，改善肠道菌群也是治疗这些疾病的重要抓手，其中包括粪菌移植疗法，也就是把健康人的粪菌提取后移植到病人肠道。但是，粪菌移植效果有很多特异性，不是每个病人都有效果。为什么呢？《自然》杂志最新发表的论文认为：病人的肠道情况对于粪菌移植的效果一样很重要。
一、粪菌移植
因为研究发现，健康人的肠道菌群是非常合理的，菌群比例、类型比较合适，而且其排出的粪便中含有这些比较合理的菌群，比单纯的益生菌组合更加好。因此，可以把这些健康人的粪便中的细菌提取出来，处理好输入到病人的肠道，有机会改善病人的肠道菌群，建立更加合理的肠道菌群。
二、肠道菌群失调影响健康
肠道菌群在人体内处于一个比较合理的平衡状态，对于健康非常重要，有害菌感染与长期的不健康生活方式可能危害肠道健康，造成肠道菌群失调，有害过多，益生菌不足。其中，艰难梭菌是最常见的医疗相关感染之一，一旦患者感染，疾病通常会复发，对患者的肠道微生物产生重大的负面影响。严重受损的肠道生态系统（例如患有艰难梭菌的人）无法自我更新，需要采用粪菌移植等等方法，来改善肠道菌群，重建肠道健康环境。
三、影响粪菌移植效果的主要因素
不列颠哥伦比亚大学欧肯那根校区工程学院Kazemian和她的导师SepidehPakpour助理教授等研究影响粪菌移植效果的因素。他们发现：用粪菌移植来进行肠道生态恢复的成功取决于几个因素，包括供体肠道微生物组、特定细菌的存在，以及粪菌移植之前病人肠道菌群的结构和缺乏特定细菌、真菌。因此，如果能够发现粪菌的捐献者与病人的肠道菌群的良好对应关系，实现更加针对性的配对，对于提高粪菌移植的效果有更大帮助。
因此，不管是采用粪菌移植还是补充益生菌，都需要考虑病人的肠道情况，做的因人而异，不能一刀切，这也是我们反对糖尿病人盲目补充益生菌的原因。