在医院,手术和抗生素治疗被发现与艰难梭菌*素引起的假膜性结肠炎的发生有关。同样,大肠杆菌、粪肠球菌等引起的败血症和脆弱拟杆菌引起的腹部脓肿也与肠道菌群组成的改变有关。富含高度加工食品的饮食会引起更多的腹胀。腹胀的个体肠道中某些细菌的数量异常增多,比如裂果胶毛螺菌(Lachnospirapectinoschiza)、人结肠厌氧棍状菌(Anaerotruncuscolihominis)和伶俐瘤胃球菌(Ruminococcuscallidus)。在腹泻期间,链球菌属的成员,特别是非解乳糖链球菌(Streptococcusalactolyticus)的数量有所减少。
炎症性肠病是一种累及回肠、直肠、结肠的特发性肠道炎症性疾病,临床表现为腹泻、腹痛甚至可有便血,包括溃疡性结肠炎和克罗恩病。研究发现,肠道菌群失调是炎症性肠病的促发因素。活动期溃疡性结肠炎患者的双歧杆菌、乳杆菌数量较健康对照显著减少;肠杆菌数量较健康对照明显增加,肠球菌及小梭菌也有增加的趋势。这表明活动期溃疡性结肠炎患者的有益菌减少和肠杆菌等条件致病菌增加导致肠道菌群失调,这可能是溃疡性结肠炎的发病原因之一。缓解期的溃疡性结肠炎患者的双歧杆菌、肠杆菌及其它细菌数量较健康对照没有显著差异,表明溃疡性结肠炎患者肠道菌群的改变程度与溃疡性结肠炎的病理改变严重程度有一定关联,改善患者的肠道菌群失调可能对于减轻肠道损伤具有帮助。
肠道菌群也是参与炎症性肠病发病的必要条件。IL-10基因敲除的小鼠可以自发形成类似于人类结肠炎,是研究炎症性肠病最常用的动物模型。然而该小鼠在无菌饲养条件下并不会发生结肠炎症,而重新恢复肠道正常菌群后则会迅速发生与人类克罗恩病非常相似的病理改变。益生菌可以通过抑制肠道致病菌、改善肠道黏膜屏障功能和调节免疫,来辅助治疗炎症性肠病。
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