肠道是人体最大的微生态系统，亦被认为是人的“第二大脑”。肠道中的有益菌、中性菌、有害菌在维系人体健康以及调节机体免疫功能方面发挥着至关重要的作用，肠道菌群失调，不仅会造成消化道疾病如炎症性肠病和肠易激综合征，还会造成一些如肥胖、糖尿病、代谢综合征、心血管疾病、过敏性疾病及精神性疾病的发生与发展。
近年来，随着专业人士对肠道菌群的研究愈发深入，通过改变肠道菌群来预防或改善某些疾病的现象已经比较普遍，其中“肠道菌群移植”的方式也得到了大众的认可。
“肠道菌群移植”又称“粪菌移植”，是将健康人粪便中的功能菌群，移植到患者胃肠道内，重建新的肠道菌群，实现肠道及肠道外疾病的治疗。
这种治疗方法在我国历史悠久，相关记载可追溯到年前东晋时期葛洪撰写的《肘后备急方》，而李时珍的《本草纲目》也有记录使用人粪治病的方法多达20余种。不过由于当时医学知识及医学伦理所限，难以给出科学的解释及研究，所以这种疗法便逐渐淡出了传统医学的范畴。但是随着现在对微生物的研究越来越深入，粪菌移植又被重新提出来，并且越来越多的研究也证实了它的有效性。
被誉为“中国益生元之母”，现任浙江师范大学硕士生导师，浙江省农业科学院微生物研究所研究员的王欣教授也曾表示过，部分肠道菌群失衡、失效的患者，通过外界摄入益生菌对其恢复肠道菌群健康是没有作用的，在这种情况下，就可以将健康的肠道菌群以“移植”的方式植入患者体内，让新的菌群在患者的肠道内定植、繁殖、生长，帮助改善其肠道环境。
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